Laboratorium Mikrobiologi Lingkungan adalah sarana penunjang aktivitas praktikum dan penelitian mahasiswa dan akademisi di Lingkungan Teknik Lingkungan dan UNTAN pada umumnya. Laboratorium Mikrobiologi Lingkungan menjadi sarana pemenuhan kegiatan praktikum Mikrobiologi Lingkungan dalam muatan 2 SKS. Adapun tujuan umum mata kuliah tersebut adalah mahasiswa dapat memahami, mempelajari dan melakukan praktikum dasar mikrobiologi dan aplikasinya secara langsung di laboratorium. Praktikum dasar mikrobiologi pada dasarnya bertujuan agar mahasiswa dapat menganalisis objek secara langsung serta cakap dalam menggunakan peralatan laboratorium. Praktikum yang dilakukan oleh mahasiswa meliputi : 1). Pengenalan alat, bahan dan pembuatan media pertumbuhan mikroorganisme serta teknik sterilisasinya 2). Isolasi Mikroorganisme 3). Faktor pembatas pertumbuhan mikroorganisme 4). Pemeriksaan air (perhitungan koliform), 5). Pewarnaan sel mikroorganisme 6). Perhitungan jumlah mikroorganisme, 7). Aplikasi bioteknologi yang bertujuan agar mahasiswa memiliki kemampuan untuk mengaplikasikan mikroorganisme dalam bioteknologi seperti dalam pengolahan limbah, pembuatan pupuk, biogas dan produk bioteknologi lainya.

Pengujian yang dapat dilakukan yaitu :

1. Uji Total Koliform 

2. Uji Total E. coli 

3. Isolasi Mikroorganisme (tidak termasuk identifikasi) 

4. Pewarnaan Gram

5. Uji bakteri Salmonella